IWBBIO 2014: CFP, Special Session on High Performance Computing in Bioinformatics

CALL FOR PAPERS

2014 International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering

(IWBBIO 2014)

7-9 April, 2014. Granada (SPAIN).

It is our great pleasure to announce the 2nd International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (IWBBIO 2014), which will take place in Granada (Spain) in April, 2014. Details and instructions for the conference can be found at the conference web site (iwbbio.ugr.es). The conference will be devoted to current researches in Bioinformatics, Computational Biology and Bioengineering, and we are looking for papers falling into the following Special Session (SS4):

High Performance Computing in Bioinformatics

The goal of this special session is to explore the use of emerging parallel computing architectures as well as High Performance Computing systems (Supercomputers, Clusters, Grids) for the simulation of relevant biological systems and for applications in Bioinformatics, Computational Biology and Computational Chemistry. We welcome papers, not submitted elsewhere for review, with a focus in topics of interest ranging from but not limited to:

  • Parallel stochastic simulation.
  • Biological and Numerical parallel computing.
  • Parallel and distributed architectures.
  • Emerging processing architectures (e.g. GPUs, Intel Xeon Phi,
    FPGAs, mixed CPU-GPU or CPU-FPGA, etc).
  • Parallel Model checking techniques.
  • Parallel algorithms for biological analysis.
  • Cluster and Grid Deployment for system biology.
  • Biologically inspired algorithms.


We encourage you to submit paper focused on interesting, relevant and original works that are related to this Special Session (SS4). We also admit the submission of short abstracts, which must be extended to full paper in case of being accepted.

 

Important dates:

These are some important dates for the submission:

  • Special session proposals: November 19th, 2013.
  • Submission of abstracts/papers by authors: November 22th, 2013.
  • Notification of provisional acceptance: December 20th, 2013.
  • Submission of final papers: January 8th, 2014.


Paper publication:
All accepted papers will be published in the conference proceedings, under both ISBN and ISSN references. Contributions will be indexed in the ISI Conference Proceedings Citation Index (Thomson Reuters) and the DBLP database.


Special issues:
A list of papers with very high quality will be selected to be extended and submitted in different special issues:

  • Theoretical Biology and Medical Modelling (BMC) (IF=1.46).
  • ArtificialIntelligenceinMedicine(IF=1.35).
  • Current Bioinformatics (IF=2.02).

 

For detailed information, please visit our website http://iwbbio.ugr.es. Thank you very much and best regards,

 


Organizers and contact:


Horacio Perez-Sanchez, PhD.

Catholic University of Murcia (UCAM) Murcia, Spain

Email: hperez[at]ucam.edu

 


José M. Cecilia, PhD.
Catholic University of Murcia (UCAM) Murcia, Spain
Email: jmcecilia[at]ucam.edu



 

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[ES] La UCAM y la Universidad de Pernambuco colaboran en la investigación de Bioinformática y Neurociencia

Marcelo Cairrao Araújo, profesor de la Universidad Federal de Pernambuco y doctor en Psicobiología, ha impartido una charla en el Aula Juzgado de laUCAM Universidad Católica San Antonio de Murcia sobre Neurociencia y Bioinformática en una actividad organizada por el Grado en Ingeniería Informática. Con su ponencia, ha dado a conocer los avances que se están produciendo en la Bioinformática dentro del campo de la Neurociencia.

Para ello, el profesor Marcelo Cairrao ha hecho especial énfasis en el funcionamiento del cerebro y los circuitos neuronales que nos hacen percibir todo lo que tenemos a nuestro alrededor: “Lo nuevo es potencialmente peligroso y por eso el sistema nervioso computa toda la información pero destaca todo aquello que es diferente. Conocer estos sistemas nos ayuda a saber cómo se toman las decisiones”.
Esta charla ha sido un paso más en la sinergia que se produce ya entre la UCAM y la Universidad Federal de Pernambuco abriendo así el camino para futuras colaboraciones entre ambas universidades en el campo de la Biomedicina.
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[ES] Jornadas ‘La supercomputación al servicio de la Bioinformática’

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El próximo viernes 31 de mayo tendrá lugar, en el Aula 13 del pabellón 5 de la UCAM, las jornadas ‘La supercompuación al servicio de la Bioinformática’ dentro del ciclo de Seminarios Científicos de la Universidad y coordinado por el Grupo de Investigación de Bioinformática y Computación de Altas prestaciones (BIOHPC). Las jornadas serán impartidas por los Doctores: José María Cecilia Canales (UCAM), Horacio Pérez Sánchez (UCAM) y Fermín Serrano Sanz (Instituto de Biocomputación y física de sistemas complejos, BIFI), en las siguientes sesiones:

11:00 – 11:30 Tendencias de la supercomputación actual  (Dr. D. José M. Cecilia)

11:30 – 12:15 Descubrimiento y optimización de compuestos bioactivos y nuevos fármacos (Dr. D. Horacio Pérez)

12:15 – 12:30 Descanso

12:30– 13:30 Presentación de Ibercivis: Plataforma de computación ciudadana (Dr. D Fermín Serrano)

En este seminario introduciremos, de manera divulgativa, las tendencias en el desarrollo de computadores científicos. Mostraremos las necesidades de cómputo de un problema de gran impacto en la sociedad, como es el descubrimiento y optimización de compuestos bioactivos y nuevos fármacos. Finalmente veremos como la computación ciudadana puede, de manera exitosa, satisfacer los requerimientos de cómputo de este tipo de aplicaciones.

Los contenidos de la conferencia están relacionados con las titulaciones de: Ingeniería Informática, Ingeniería en Sistemas de Telecomunicación, Medicina, Tecnología de los Alimentos, aunque puede asistir cualquier persona interesada en la temática.

Os pedimos que comuniquéis esta información entre vuestros compañeros y alumnos que puedan estar interesados.

 

P.D: Aquí el vídeo resumen de las jornadas

 

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We have been invited to this NVIDIA sponsored GPU Workshop organised by José García at the University of Alicante

Curso de programaci—n de aplicaciones c ientíficas y de visión por comput...

Detailed information can be found here and here. This workshop has been also  included in the CUDA Week in Review as:  GPU Summer School (University of Alicante)July 22-24, 2013 Alicante, Spain:

http://www.nvidia.com/content/newsletters/web/CUDA-Week-in-Review-may-06-13-web.html

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